Yayasan Kotex Mandiri mulai dirintis atas dasar kebutuhan anggota untuk berkumpul, berbagi dan saling menguatkan dengan yang lain dalam menghadapi stigma dan diskriminasi terhadap orang yang hidup dan terdampak langsung dengan HIV. Berdiri pada tanggal 21 Juli 2006, yang kemudian berinisiatif untuk melegalkan menjadi sebuah yayasan social dengan akte Notaris Eva Junaida SH no. 28 tanggal 22 Mei 2008.
Yayasan Kotex memiliki beberapa tujuan antaralain memberikan informasi yang memadai mengenai bahaya HIV AIDS dan dampak buruk napza, membantu proses rujukan ke layanan Kesehatan yang dibutuhkan oleh orang dengan HIV yang terdampak serta mengembangkan kapasitas orang dengan HIV yang terdampak dengan meningkatkan pengetahuan dan keterampilan serta mengembangkan jaringan di tingkat local dan nasional.
